Medullær svampenyre er en kongenit sygdom, hvor dele af samlerørsystemet er sæde for cystisk dilatation. Stensygdommen er ofte massiv og bilateral. Tilstanden, der diagnosticeres radiologisk, er sædvanligvis ledsaget af hypercalciuri og hypocitraturi. Nogle patienter har recidiverende infektioner, som kan kræve profylaktisk antibiotika. Behandlingen omfatter i øvrigt rigeligt væskeindtag, kaliumcitrat og thiaziddiuretika afhængig af den dominerende risikofaktor.